Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIDRQ14159 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms