Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM53BQ14153 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM53BQ14153 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms