Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms