Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
XRCC4Q13426 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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