Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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PMS2P3Q13401 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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