Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCB1Q12824 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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