Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms