Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms