Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN12Q05209 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms