Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms