Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CD164Q04900 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CD164Q04900 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms