Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POU5F1Q01860 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms