Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms