Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms