Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
RPS29P62273 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
RPS29P62273 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms