Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1S1P61966 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP1S1P61966 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms