Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBASH3AP57075 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms