Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms