Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PGGT1BP53609 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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