Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1P51787 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms