Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms