Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERFP50548 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERFP50548 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms