Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF6P49848 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF6P49848 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF6P49848 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms