Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms