Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms