Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAEP38570 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms