Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CHRNA7P36544 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms