Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRMP28827 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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