Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBL1P28749 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBL1P28749 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms