Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms