Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT1P26358 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms