Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CXCR1P25024 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms