Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPRBP23467 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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