Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GCSHP23434 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GCSHP23434 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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GCSHP23434 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GCSHP23434 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GCSHP23434 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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