Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DESP17661 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DESP17661 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DESP17661 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms