Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM200BP0CF97 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM200BP0CF97 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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