Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT6BP04259 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms