Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFP01375 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFP01375 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms