Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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