Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPAG9O60271 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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