Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRICKLE3O43900 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms