Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBDO15205 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBDO15205 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms