Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TO15178 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TO15178 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TO15178 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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