Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRTO14522 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
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