Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3CA6NKF2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms