Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP69A5D8W1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms