Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms