Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1Q9Y3L3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms