Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP11Q9Y3A2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP11Q9Y3A2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms