Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM5BQ9UGL1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms